Zymo Research เปิดตัวซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศศาสตร์ รองรับการตรวจหาเชื้อโควิดในน้ำเสีย
การเปิดตัว VirSieve(TM) Bioinformatics Pipeline จะช่วยส่งเสริมความร่วมมือด้านการวิจัยไวรัส SARS-CoV-2 ในสิ่งแวดล้อม Zymo Research เปิดตัวซอฟต์แวร์ VirSieve(TM) Bioinformatics Pipeline สำหรับชุมชนจุลชีววิทยาสิ่งแวดล้อม เพื่อส่งเสริมความร่วมมือทั่วโลกและสนับสนุนการตรวจหาเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 สายพันธุ์ต่าง ๆ ในน้ำเสีย โดย VirSieve(TM) เป็นซอฟต์แวร์อัตโนมัติที่สามารถวิเคราะห์ลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 จากตัวอย่างน้ำเสีย เพื่อให้เข้าใจมากขึ้นเกี่ยวกับสายพันธุ์ของไวรัสที่พบในชุมชน ซอฟต์แวร์นี้สามารถประเมินช่วงความเชื่อมั่น (confidence interval) ในการกลายพันธุ์ของไวรัส จึงวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสได้อย่างแม่นยำขึ้นมาก ศูนย์ควบคุมและป้องกันโรคของสหรัฐอเมริกา (CDC) ระบุว่า การฉีดวัคซีนมีผลดีอย่างมหาศาลในการควบคุมการแพร่ระบาดของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 ในสหรัฐอเมริกา แต่ยังคงมีไวรัสสายพันธุ์ใหม่เกิดขึ้น โดยบางสายพันธุ์ เช่น B.1.1.7 ถูกจัดว่าเป็น “สายพันธุ์น่ากังวล” เนื่องจากมีหลักฐานว่าแพร่กระจายเร็วขึ้น มีความสามารถในการก่อโรคมากขึ้น หรือดื้อวัคซีนมากขึ้น ด้วยเหตุนี้ การตรวจหาเชื้อในน้ำเสียจึงเป็นทางออกที่เหมาะสมที่สุดในการตรวจตราสถานการณ์ในชุมชนแบบเกือบเรียลไทม์ การตรวจลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสในน้ำเสียเป็นเรื่องที่ทำได้ยาก เนื่องจาก RNA ของไวรัสมีการเสื่อมและแตกกระจาย ส่งผลให้การตรวจลำดับสารพันธุกรรมของเชื้อไวรัสเกิดความผิดพลาด จนทำให้เกิดการเข้าใจผิดว่ามีการกลายพันธุ์ อย่างไรก็ดี VirSieve(TM) […]